Max Planck Institute for the Structure and Dynamics of Matter

Publications of K. Ayyer

All genres

Journal Article (20)

2024

Journal Article

Resolving Nonequilibrium Shape Variations among Millions of Gold Nanoparticles

Z. Shen, P. L. Xavier, R. Bean, J. Bielecki, M. Bergemann, B. J. Daurer, T. Ekeberg, A. D. Estillore, H. Fangohr, K. Giewekemeyer, M. Karnevskiy, R. A. Kirian, H. Kirkwood, Y. Kim, J. C. P. Koliyadu, H. Lange, R. Letrun, Lübke J., A. Mall, T. Michelat, A. J. Morgan, N. Roth, A. K. Samanta, T. Sato, M. Sikorski, F. Schulz, P. Vagovic, T. Wollweber, L. Worbs, F. Maia, D. A. Horke, Küpper J, A. P. Mancuso, H. Chapman, K. Ayyer, N. D. Loh

ACS Nano 18 (24), 15576–15589 (2024)

MPG.PuRe

supplementary-material

publisher-version

Journal Article

Introducing: Ulrich J. Lorenz, Radoslav I. Enchev, Clare F. Megarity, Helen Ginn, Patrick Rabe, Alice R. Walker, and Kartik Ayyer

U. J. Lorenz, R. I. Enchev, C. F. Megarity, H. Ginn, P. Rabe, A. R. Walker, K. Ayyer

Structure 32 (5), 511–516 (2024)

MPG.PuRe

publisher-version

Journal Article

Nanoscale x-ray imaging with high spectral sensitivity using fluorescence intensity correlations

T. Wollweber, K. Ayyer

Structural Dynamics 11 (2), 024307 (2024)

MPG.PuRe

publisher-version

Journal Article

Observation of a single protein by ultrafast X-ray diffraction

T. Ekeberg, D. Assalauova, J. Bielecki, R. Boll, B. J. Daurer, L. A. Eichacker, L. E. Franken, D. E. Galli, L. Gelisio, L. Gumprecht, L. H. Gunn, J. Hajdu, R. Hartmann, D. Hasse, A. Ignatenko, J. Koliyadu, O. Kulyk, R. Kurta, M. Kuster, W. Lugmayr, J. Lübke, A. P. Mancuso, T. Mazza, C. Nettelblad, Y. Ovcharenko, D. E. Rivas, M. Rose, A. K. Samanta, P. Schmidt, E. Sobolev, N. Timneanu, S. Usenko, D. Westphal, T. Wollweber, L. Worbs, P. L. Xavier, H. Yousef, K. Ayyer, H. N. Chapman, J. A. Sellberg, C. Seuring, I. A. Vartanyants, J. Küpper, M. Meyer, F. R. N. C. Maia

Light: Science & Applications 13, 15 (2024)

MPG.PuRe

publisher-version

supplementary-material

Journal Article

New aerodynamic lens injector for single particle diffractive imaging

N. Roth, D. A. Horke, J. Lübke, A. K. Samanta, A. D. Estillore, L. Worbs, N. Pohlman, K. Ayyer, A. Morgan, H. Fleckenstein, M. Domaracky, B. Erk, C. Passow, J. Correa, O. Yefanov, A. Barty, S. Bajt, R. A. Kirian, H. N. Chapman, J. Küpper

Nuclear Instruments and Methods in Physics Research Section A: Accelerators, Spectrometers, Detectors and Associated Equipment 1058, 168820 (2024)

MPG.PuRe

2023

Journal Article

Form factor determination of biological molecules with X-ray free electron laser small-angle scattering (XFEL-SAS)

C. E. Blanchet, A. Round, H. D. T. Mertens, K. Ayyer, M. Graewert, S. Awel, D. Franke, K. Dörner, S. Bajt, R. Bean, T. F. Custódio, R. de Wijn, E. Juncheng, A. Henkel, A. Gruzinov, C. M. Jeffries, Y. Kim, H. Kirkwood, M. Kloos, J. Knoška, J. Koliyadu, R. Letrun, C. Löw, J. Makroczyova, A. Mall, R. Meijers, G. E. P. Murillo, D. Oberthür, E. Round, C. Seuring, M. Sikorski, P. Vagovic, J. Valerio, T. Wollweber, Y. Zhuang, J. Schulz, H. Haas, H. N. Chapman, A. P. Mancuso, D. Svergun

Communications Biology 6, 1057 (2023)

MPG.PuRe

publisher-version

Journal Article

Ab initio spatial phase retrieval via intensity triple correlations

N. Peard, K. Ayyer, H. N. Chapman

Optics Express 31 (15), 25082–25092 (2023)

MPG.PuRe

publisher-version

supplementary-material

Journal Article

Time-Resolved Single-Particle X-ray Scattering Reveals Electron-Density Gradients As Coherent Plasmonic-Nanoparticle-Oscillation Source

D. Hoeing, R. Salzwedel, L. Worbs, Y. Zhuang, A. K. Samanta, J. Lübke, A. Estillore, K. Dlugolecki, C. Passow, B. Erk, N. Ekanayaje, D. Ramm, J. Correa, C. C. Papadooulou, A. T. Noor, F. Schulz, M. Selig, A. Knorr, K. Ayyer, J. Küpper, H. Lange

Nano Letters 23 (13), 5943–5950 (2023)

MPG.PuRe

supplementary-material

Journal Article

Inter-Bragg crystallographic phase retrieval from shape transforms, stacking faults and substitutional disorder

J. P. J. Chen, K. Pande, J. J. Donatelli, A. V. Martin, K. Ayyer, H. N. Chapman, R. Bean, K. E. Schmidt, R. A. Kirian

Ultramicroscopy 249, 113728 (2023)

MPG.PuRe

Journal Article

Holographic Single-Particle Imaging for Weakly Scattering, Heterogeneous Nanoscale Objects

A. Mall, K. Ayyer

Physical Review Applied 19 (5), 054027 (2023)

MPG.PuRe

publisher-version

Journal Article

Imaging via Correlation of X-Ray Fluorescence Photons

F. Trost, K. Ayyer, M. Prasciolu, H. Fleckenstein, M. Barthelmess, O. Yefanov, J. L. Dresselhaus, C. Li, S. Bajt, J. Carnis, T. Wollweber, A. Mall, Z. Shen, Y. Zhuang, S. Richter, S. Karl, S. Cardoch, K. K. Patra, J. Möller, A. Zozulya, R. Shayduk, W. Lu, F. Brauße, B. Friedrich, U. Boesenberg, I. Petrov, S. Tomin, M. Guetg, A. Madsen, N. Timneanu, C. Caleman, R. Röhlsberger, J. von Zanthier, H. N. Chapman

Physical Review Letters 130 (17), 173201 (2023)

MPG.PuRe

publisher-version

supplementary-material

Journal Article

Speckle contrast of interfering fluorescence X-rays

F. Trost, K. Ayyer, D. Oberthuer, O. Yefanov, S. Bajt, C. Caleman, A. Weimer, A. Feld, H. Weller, S. Boutet, J. Koglin, N. Timneanu, J. von Zanthier, R. Röhlsberger, H. N. Chapman

Journal of Synchrotron Radiation 30 (1), 11–23 (2023)

MPG.PuRe

publisher-version

2022

Journal Article

Unsupervised learning approaches to characterizing heterogeneous samples using X-ray single-particle imaging

Y. Zhuang, S. Awel, A. Barty, R. Bean, J. Bielecki, M. Bergemann, B. J. Daurer, T. Ekeberg, A. D. Estillore, H. Fangohr, K. Giewekemeyer, M. S. Hunter, M. Karnevskiy, R. A. Kirian, H. Kirkwood, Y. Kim, J. Koliyadu, H. Lange, R. Letrun, J. Lübke, A. Mall, T. Michelat, A. J. Morgan, N. Roth, A. K. Samanta, T. Sato, Z. Shen, M. Sikorski, F. Schulz, J. C. H. Spence, P. Vagovic, T. Wollweber, L. Worbs, P. L. Xavier, O. Yefanov, F. R. N. C. Maia, D. A. Horke, J. Küpper, N. D. Loh, A. P. Mancuso, H. N. Chapman, K. Ayyer

IUCrJ 9 (2), 1–11 (2022)

MPG.PuRe

publisher-version

2021

Journal Article

An encryption-decryption framework for validating single-particle imaging

Z. Shen, C. Z. W. Teo, K. Ayyer, N. D. Loh

Scientific Reports 11, 971 (2021)

MPG.PuRe

publisher-version

supplementary-material

Journal Article

3D diffractive imaging of nanoparticle ensembles using an x-ray laser

K. Ayyer, P. L. Xavier, J. Bielecki, Z. Shen, B. J. Daurer, A. K. Samanta, S. Awel, R. Bean, A. Barty, T. Ekeberg, A. D. Estillore, H. Fangohr, K. Giewekemeyer, M. S. Hunter, M. Karnevskiy, R. A. Kirian, H. Kirkwood, Y. Kim, J. Koliyadu, H. Lange, R. Letrun, J. Lübke, T. Michelat, A. J. Morgan, N. Roth, T. Sato, M. Sikorski, F. Schulz, J. C. H. Spence, P. Vagovic, T. Wollweber, L. Worbs, O. Yefanov, Y. Zhuang, F. R. N. C. Maia, D. A. Horke, J. Küpper, N. D. Loh, A. P. Mancuso, H. N. Chapman

Optica 8 (1), 15–23 (2021)

MPG.PuRe

publisher-version

2020

Journal Article

Diffraction data from aerosolized Coliphage PR772 virus particles imaged with the Linac Coherent Light Source

H. Li, R. Nazari, B. Abbey, R. Alvarez, A. Aquila, K. Ayyer, A. Barty, P. Berntsen, J. Bielecki, A. Pietrini, M. Bucher, G. Carini, H. N. Chapman, A. Contreras, B. J. Daurer, H. DeMirci, L. Flűckiger, M. Frank, J. Hajdu, M. F. Hantke, B. G. Hogue, A. Hosseinizadeh, M. S. Hunter, H. O. Jönsson, R. A. Kirian, R. P. Kurta, D. Loh, F. R. N. C. Maia, A. P. Mancuso, A. J. Morgan, M. McFadden, K. Muehlig, A. Munke, H. K. N. Reddy, C. Nettelblad, A. Ourmazd, M. Rose, P. Schwander, M. Marvin Seibert, J. A. Sellberg, R. G. Sierra, Z. Sun, M. Svenda, I. A. Vartanyants, P. Walter, D. Westphal, G. Williams, P. L. Xavier, C. H. Yoon, S. Zaare

Scientific Data 7, 404 (2020)

MPG.PuRe

publisher-version

Journal Article

Photon statistics and signal to noise ratio for incoherent diffraction imaging

F. Trost, K. Ayyer, H. N. Chapman

New Journal of Physics 22 (8), 083070 (2020)

MPG.PuRe

publisher-version

Journal Article

Megahertz single-particle imaging at the European XFEL

E. Sobolev, S. Zolotarev, K. Giewekemeyer, J. Bielecki, K. Okamoto, H. K. N. Reddy, J. Andreasson, K. Ayyer, I. Barak, S. Bari, A. Barty, R. Bean, S. Bobkov, H. N. Chapman, G. Chojnowski, B. J. Daurer, K. Dörner, T. Ekeberg, L. Flückiger, O. Galzitskaya, L. Gelisio, S. Hauf, B. G. Hogue, D. A. Horke, A. Hosseinizadeh, V. Ilyin, C. Jung, C. Kim, Y. Kim, R. A. Kirian, H. Kirkwood, O. Kulyk, J. Küpper, R. Letrun, N. D. Loh, K. Lorenzen, M. Messerschmidt, K. Mühlig, A. Ourmazd, N. Raab, A. V. Rode, M. Rose, A. Round, T. Sato, R. Schubert, P. Schwander, J. A. Sellberg, M. Sikorski, A. Silenzi, C. Song, J. C. H. Spence, S. Stern, J. Sztuk-Dambietz, A. Teslyuk, N. Timneanu, M. Trebbin, C. Uetrecht, B. Weinhausen, G. J. Williams, P. L. Xavier, C. Xu, I. A. Vartanyants, V. S. Lamzin, A. Mancuso, F. R. N. C. Maia

Communications Physics 3 (1), 97 (2020)

MPG.PuRe

publisher-version

supplementary-material

Journal Article

Reference-enhanced x-ray single-particle imaging

Optica 7 (6), 593–601 (2020)

MPG.PuRe

publisher-version

2019

Journal Article

Low-signal limit of X-ray single particle diffractive imaging

K. Ayyer, A. J. Morgan, A. Aquila, H. DeMirci, B. G. Hogue, R. A. Kirian, L. X. Paulraj, C. H. Yoon, H. N. Chapman, A. Barty

Optics Express 27 (26), 37816–37833 (2019)

MPG.PuRe

publisher-version